По голямата част от планината представлява гранитен батолит, ограден от метаморфна мантия.
Сакар е ниска планина с плоски върхове. От най-високия връх Вишеград (856 м), в централната част на планината, заобленото било се разклонява на запад и на изток на къси, стръмни ридове, отделени от дълбоки долове. Южните склонове са сравнително по-стръмни, на места прорязани от ровини и речни долини. В източните части на планината има окарстени мрамори.
Тя е един от най-богатите райони в България на много грабливи птици, които са на изчезване. В Сакар се намират 7 от 12-те известни в България гнездилища на застрашения в световен мащаб царски орел. Това прави планината важно място за екологията и защитата на българската флора и фауна.
Сакар е и сърцето на българската мегалитна култура – район, богат на долмени, тракийски светилища и древни некрополи, които разкриват хилядолетната история на тези земи.
Планината е прочута и със своя винен тероар и сортове, които се отглеждат по слънчевите ѝ склонове.
